Suomessa toimii kolme liiketoimintaryhmää, terveydenhuoltoon keskittynyt Bayer HealthCare, teollisuuden raaka-ainetarpeita palveleva Bayer MaterialScience sekä yksi Suomen johtavista kasvinsuojelualan toimijoista Bayer CropScience.
Bayer HealthCaren alla toimivat itsehoitolääkkeisiin keskittynyt Consumer Care, diabeteksen hoidon seurannan välineisiin erikoistunut Diabetes Care ja reseptilääkkeisiin keskittynyt Bayer Schering Pharma.
Bayerin ja Scheringin integraation myötä Bayerilla on Suomessa 1.4.2007 lähtien kaksi yhtiötä, Bayer Oy ja Bayer Schering Pharma Oy.
Bayer Oy
Bayer Oy markkinoi Bayer-konsernin koko tuotevalikoimaa Suomessa: Bayerin ja entisen Scheringin reseptilääkkeitä, itsehoitolääkkeitä, kasvinsuojelun tuotteita sekä korkealaatuisia materiaaleja ja kemikaaleja.
Bayer Oy:n toimipiste on Espoossa. Markkinoinnin parissa työskentelee koko maan kattava edustajaverkosto.
Bayer Schering Pharma Oy
Bayer Schering Pharma Oy keskittyy reseptilääkkeiden osalta kansainväliseen toimintaan: tutkimukseen ja tuotekehitykseen, tuotantoon ja Suomessa valmistettujen tuotteiden kansainväliseen vientiin.
Bayer Schering Pharma Oy:n toimipisteet ovat Turussa ja Espoossa.


